5 февраля (25 января по старому стилю) 1780 года Указом императрицы Екатерины Второй Пинега получила статус города.
Городской планировкой Пинеги занималась сама Екатерина Великая. На месте упразднённого Кеврольского уезда и части Двинского уезда был образован уезд Пинежский Архангельской области Вологодского наместничества, а Пинега превратилась из погоста Пинежский волок в Двинском уезде Архангелогородской губернии в уездный город.
В Пинеге есть настоящее историческое место «Володинский квартал». Названо оно в честь династии купцов Володиных. Володины в буквальном смысле слова были градообразующей династией, которая оставила после себя множество каменных строений: магазины, пекарню, школу, особняки, склады. Был у купцов даже свой лесозавод и электростанция.
В XIX веке Пинега — глухой купеческий городок, место ссылки (из революционеров тут были Ворошилов, Рыков, Серафимович).
В пинежской ссылке закончил свой земной путь фаворит царицы Софьи Василий Васильевич Голицын, он был захоронен в Красногорском мужском монастыре на Красной горке в 15 км от посёлка.
Об истории посёлка можно узнать много интересных фактов в местном краеведческом музее, который расположен в старинном володинском особняке.
